Gestion agroécologique du flétrissement bactérien (Ralstonia solanacearum & Rastonia pseudosolanacearum) dans les systèmes maraîchers en zone tropicale

Domaine d’expertise

• Epidémiologie du flétrissement bactérien des Solanacées
• Gestion agroécologique du flétrissement bactérien en zone tropicale : utilisation de plantes de services et développement de solutions de biocontrôle. 
  
• Etude de la diversité génétique des populations du complexe d’espèces.

Contexte et problématique

Les productions horticoles, et plus particulièrement les cultures maraîchères, sont des pivots de la diversification agricole aux Antilles. Le développement et la pérennité de ces cultures ne pourront être assurées et consolidées qu’avec le contrôle d’un certain nombre de bioagresseurs, dont les plus problématiques vivent dans le sol. L’unité de phytopathologie du CAEC travaille sur les maladies bactériennes telluriques et principalement sur le flétrissement bactérien. L’agent responsable appartient à un complexe d’espèces précédemment attribué à Ralstonia solanacearum (RS). Il s’agit d’un organisme de quarantaine figurant sur la liste A2 pour l’OEPP. L’unité de phytopathologie du CAEC développe des méthodes innovantes basées sur l’introduction d’espèces végétales assainissantes, sur l’utilisation d’extraits naturels et de microorganismes antagonistes pour réguler le flétrissement bactérien chez les Solanacées (modèle tomate) en région tropicale.

Description de la structure

Des équipements :

• Un laboratoire de microbiologie (isolement, purification et culture bactériennes)
• Un laboratoire de biologie moléculaire (extraction, amplification PCR et révélation de l’ADN)
• Une chambre climatique
• Une serre
• Des stations expérimentales multi-sites agro-pédoclimatiques.

Activités scientifiques

Recherche de plantes assainissantes introduites en rotation-association culturale avec la tomate pour la biodésinfection des sols maraîchers

• Plantes assainissantes-modèles : Allium spp.  et Crotalaria spp.
• Evaluation en conditions contrôlées et réelles du potentiel de biocontrôle des espèces candidates (diminution de la population pathogène et du potentiel infectieux du sol).
• Etude des mécanismes d’action (rupture du cycle infectieux, effet biocide, effets indirects via les populations microbiennes).
• Optimisation du potentiel de biocontrôle des plantes assainissantes (période d’implantation, densité de semis, etc.).

Recherche d’extraits naturels et de microorganismes antagonistes pour le développement de nouveaux produits

• Extraits végétaux à base d’huile essentielle, broyats végétaux, bactéries antagonistes.
• Evaluation du potentiel de biocontrôle des extraits/antagonistes.
• Etude des mécanismes d’action (effet biocide, effet PGPR).

Etude de la diversité des populations du complexe d’espèces

• Caractérisation moléculaire et étude du pouvoir pathogène des populations de R. solanacearum et R. pseudosolanacearum d’origine diverse.