Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP)

Pour répondre aux grands enjeux de l'agriculture méditerranéenne et tropicale, l'unité mixte Agap se donne comme ambition de mettre en synergie une grande diversité de compétences, d'approches et de ressources pour des plantes cultivées mieux adaptées à des agrosystèmes variés. L’UMR Agap regroupe plus de 400 personnes développant une recherche scientifique d’excellence en biologie des plantes et génétique végétale, réparties en 14 équipes.

Agap gère 4 plateformes, des collections importantes de ressources génétiques (CRB), et travaille dans trois champs thématiques :

  • Diversité et génome : structure, domestication, milieux, sociétés
  • Développement et adaptation des plantes et des peuplements
  • Approches intégratives pour l’innovation variétale

En Martinique, l’UMR est représentée par une partie de l’équipe SEAPAG (Structure Evolutive des Agrumes, Polyploïdie et Amélioration Génétique) qui développe un programme d’amélioration des agrumes pour les Antilles et par des techniciens en charge de la collection d’ananas du CRB-PT (Centre de Ressources Biologiques Plantes Tropicales). L'objectif finalisé de SEAPAG, est de développer des variétés et porte-greffes d’agrumes adaptés à des systèmes de production et de commercialisation durables.

Les recherches, portant sur la caractérisation des ressources génétiques, l’analyse des structures des génomes, de leurs dynamiques et de leur fonctionnement pour l’élaboration du phénotype, sont intégrées pour optimiser la création variétale et sélectionner du matériel innovant.

L’agrumiculture moderne repose sur des vergers de plants greffés et les objectifs de sélection se scindent en 2 parties, sur les variétés et les porte-greffes. Pour les variétés, la qualité des fruits, dont l’aspermie est un critère essentiel pour le marché du fruit frais, l’étalement des productions sur l’année et la résistance à certaines maladies (Alternaria des mandariniers, anthracnose des limettiers, …) sont les principales cibles. Pour les porte-greffes, la sélection porte sur un meilleur comportement vis-à-vis de la maladie du Huanglongbing ou greening des agrumes (HLB) ainsi que l’adaptation aux contraintes abiotiques des principaux bassins de productions, en intégrant la résistance aux Phytophthora et au virus de la Tristeza qui sont essentiels pour tout porte-greffes. L’adaptation à des systèmes de production agroécologiques, c’est-à-dire à bas niveau d’intrants est également ciblée.  La sélection et la validation des variétés sont conduites en partenariat avec les acteurs de la recherche, du développement et des filières.